Hayır. BAGEP Programı doktorasını veya uzmanlığını almış kişilere açıktır.
Başvuru dili Türkçe’dir. Bütün başvuru evraklarının Türkçe olarak düzenlenmesi gerekmektedir. Anadili Türkçe olmayan bilim insanları başvurularını İngilizce yapabilirler.
Hayır. Adaylar, BAGEP Burs Ödülü’nün verildiği dönem itibariyle Türkiye’de ya da K.K.T.C.’de yer alan bir kuruluşta çalışıyor olmalıdır. Bununla birlikte geçici olarak yurtdışında bulunan ve Haziran 2022 sonuna kadar Türkiye’deki görevine dönecek olanlar ya da Haziran 2022 itibariyle Türkiye’de işe başlayacak olanlar da başvurabilir.
Hayır. Burs programı uzun vadeli bir program olduğundan, adayların BAGEP desteğinin geçerli olacağı 2 yıl süresince Türkiye’deki bir kurumda çalışıyor olması gerekmektedir.
Hayır. Başvuracak adayların BAGEP Burs Ödülü’nün verildiği dönem itibariyle Türkiye’de yer alan bir kuruluşta çalışıyor olması gerekmektedir.
Evet. Adayların, Türkiye’deki bir kurumda sürekli çalışıyor olması gerekmektedir. Sürekli çalışmanın part-time ya da full-time olmasından ziyade adayın araştırma planı ve özgeçmişi önem arz etmektedir.
GEBİP gibi benzer programlara başvurmuş ve kazanmış olanlar, BAGEP’e de başvurabilir ve kazandıkları takdirde ödüllerini alabilirler. 
BAGEP Ödülüne başvuru için, başvuru tarihi itibariyle alınan ilk doktora ya da eşdeğeri dereceden itibaren en çok 8 yıl geçmiş olmalıdır. Adayların çalışma yaşamını etkileyen, 1 yılı aşkın mazeret durumları (askerlik, ebeveynlik izni, ağır hastalık vb.) Yönetim Kurulu tarafından değerlendirilerek karara bağlanır. Ayrıca, kadın adaylar için hamilelik ve doğum süreçleri dikkate alınarak, doğum başına 18 ay eklenir. Ek olarak, 2028 yılına kadar yapılacak başvurular için ilk doktora ya da eşdeğeri dereceden itibaren geçen süreden bağımsız olarak ödül yılının başında 40 yaşını doldurmamış olmak yeterli sayılacaktır. Yaş üst sınırı, yukarıda belirtilen mazeret gerekçelerinin süresi dikkate alınarak yükseltilebilir.
Bir aday üst üste iki yıl başvuru yapamaz ve toplamda en fazla üç kez başvuru hakkı vardır.  
BAGEP ödülleri için öncelikli alanlar yoktur. Ödüller her alanda verilmektedir. Sadece az sayıda ödül destekçilerin tercihleri doğrultusunda belirli alanlara tahsis edilebilir 
Çıkar çatışması bulunan jüri üyeleri, ilgili adayların değerlendirmelerine katılmazlar.